Главная Семестры Проекты Обо мне RUS/ENG

I семестр Описание белка BCCP_ECOLI и гена, кодирующего его последовательность Файл с общей характеристикой белка в формате word Описание гена accB Состав записи 1bdo банка PDB Описание общей формы белка BCCP Контакты лиганда биотин с белком BCCP по данным записи 1bdo Элемент вторичной структуры белка BCCP Контакты бета-тяжей Thr114 - Ala126 Met123 - Glu126 с остальной структурой Торсионные углы Описание бактерии Onion Yellows II семестр Базы данных и поисковые системы Информация о белке BCCP_ECOLI из базы данных UniProt Поисковые системы SRS, MRS, UniProt База данных PubMed Зачетное задание: Файл с общей характеристикой белка BCCP_ECOLI в формате word Парное выравнивание и поиск по сходству Пробное выравнивание Глобальное и локальное выравнивания Работа с пакетом BLAST Множественное выравнивание Биологический смысл выравнивания Множественное выравнивание последовательностей Паттерны и профили PSI-Blast III семестр Структуры нуклеиновых кислот Исследование структуры тРНК Исследование ДНК-белкового комплекса Последовательности нуклеиновых кислот Банк EMBL BLASTALL Сигналы в нуклеотидных последовательностях Работа с сервером MEME IV семестр Филогенетические деревья Филогенетические деревья Поиск диагностических позиций Сервис TreeTop Реконструкция филогенетических деревьев Работа с нуклеотидными последовательностями и деревьями с паралогами Функции Pfam Gene Ontology Ферменты и метаболические пути Мембранные белки, транспортные белки. V семестр Структурная биоинформатика Введение в PyMOL Программы DSSP и HBplus Электронная плотность Кристаллографическая симметрия Технические характеристики PDB Качество структуры Поверхность контактов, гидрофобные взаимодействия, домены Пространственное выравнивание и совмещение SCOP и CATH VI семестр Молекулярное моделирование биополимеров Введение в PyMOL Семи-эмпирические вычисления: MOPAC Ab initio вычисление для нафталина и азулена Вычисление параметров для молекулярной механики Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики

---

© Яшина 2009