Учебный сайт
Главная Семестры Проекты Обо мне

Контакты лиганда биотин с белком BCCP по данным записи 1bdo

Лиганд биотин состоит из 15 атомов. В белковой цепи с лигандом взаимодействуют остатки(находятся на расстоянии менее 5 ангстрем, т.е. могут образовывать водородные или гидрофобные взаимодействия):
  • Tyr92 (тирозин 92)
  • Thr94 (треонин 94)
  • Pro95 (пролин 95)
  • Ser96 (серин 96)
  • Pro97 (пролин 97)
  • Ile117 (изолейцин 117)
  • Glu119 (глутаминовая кислота 119)
  • Lys122 (лизин 122)
  • Met124 (метионин 124)
Лиганд(зеленый) и белковая цепь(желтый - бета-тяжи, синий - бета-повороты
Лиганд(зеленый) и белковая цепь(желтый - бета-тяжи, синий - бета-повороты)
Выберем один из взаимодействующих остатков белка: Pro97(пролин под номером 97 в цепи). Его взаимное расположение с лигандом:
Лиганд и пролин

© Яшина 2009