| По данным банка PDB были построены карты Рамачандрана [изображенные в координатах торсионных углов ψ[угол вращения вокруг связи Ca-C] и φ[угол вращения вокруг связи N-Ca] "разрешенные" и "запрещенные" конформации остатка] для 2 антипараллельных бета-тяжей из белковой цепи и собственно самой цепи(синими точками отмечены разрешенные конформации).
|
|
 |
По полученным картам видно, что для бета-тяжей характерными являются углы: φ от -150° до -60°, ψ от 100° до 170°. Так как белок бета-структурный, то карта Рамачандрана для отдельной бетатяжевой пары должна быть аналогична карте для всей цепи, что и видно на изображениях.
Однако на картах также присутствуют точки, не относящиеся к области бета-тяжей.
- в области φ от -120° до -60° и ψ от -60° до 0° встречаются остатки пролина, лейцина, аспарагиновой кислоты(малоподвижные остатки);
- в области φ от 60° до 120° и ψ от -30° до 60° остатки преимущественно глицина(есть метионин, лизин, аспарагиновая кислота).
Две последние области, вероятно, соотвествуют бета-поворотам(которые также присутствуют в цепи).
| |
