Бета-тяжи, помимо того, что взаимодействуют друг с другом, образуют водородные связи и гидрофобные взаимодействия с остальной молекулой(гидрофобными будем называть взаимодействия между атомами углерода или серы из боковых цепей, а водородными - взаимодействия между атомами азота или кислорода). Водородные связи ограничим по расстоянию между атомами - не более 3.7 ангстрем, а гидрофобные - не более 5.0 ангстрем.
Тогда можно найти и изобразить атомы в молекуле, которые будут удовлетворять этим условиям.
На первом рисунке изображены водородные взаимодействия: желтым показаны бета-тяжи, белым - оставшаяся молекула, красным отмечены атомы азота и кислорода, принадлежащие бета-тяжам, а синим - принадлежащие остальной молекуле; взаимодействия возможны между синими и красными атомами.
На втором рисунке изображены гидрофобные взаимодействия: желтым отмечены бета-тяжи, белым - оставшаяся часть молекулы, оранжевым отмечены атомы углерода и серы из боковых цепей бета-тяжей, а зеленым - из остальной молекулы; взаимодействия возможны между атомами зеленого и оранжевого цвета.
|
 |  |
|
