Диагностические позиции
Выравнивание программой muscle было импортировано в Gendoc:
Затем в выравнивании были выделены группы, соответствующие таксонам Alphaproteobacteria (AGRRK, RHOS4) и Enterobacteriaceace (ERWCT, ECOLI, YERPE). Внутри групп были покрашены консервативные позиции:
Среди окрашенных позиций диагностическими оказались:
pos Entero Alpha pos Entero Alpha
177 - K
15 R - | 178 G -
17 - G | 179 A -
22 - D | 180 D -
23 C - | 182 E -
30 A T | 183 L -
39 - D | 184 V -
40 N W | 191 H Q
43 K - | 200 K N
44 S K | 202 E L,M
46 - I,L | 203 Y,F A
50 A - | 206 P -
55 R - | 208 D -
56 I,V T | 210 - D
59 - E | 211 A -
64 - I,V | 212 E -
65 K - | 214 V -
66 I,V - | 215 - E
69 D - | 218 - R
72 Y - | 219 Q -
75 I - | 221 Q -
80 C S | 222 L -
90 G - | 223 - E,Q
92 - Q | 224 I -
93 A - | 225 A -
94 F L,M | 226 I,M -
95 - V | 230 S -
97 - G | 231 G -
98 V - | 240 R,K -
99 I,L - | 241 E A
100 N,D - | 246 K -
101 A - | 249 E -
104 A S,T | 256 T -
106 K D | 259 V -
107 I - | 260 S -
109 D - | 262 T L
111 - E | 263 G -
114 K - | 268 M I
116 - A | 269 - N
122 - G | 271 - D
123 - K | 272 K L
125 F V | 275 G -
126 E - | 278 L -
127 E - | 281 - A
128 Q,E T | 282 N -
129 R I,L | 290 - E
132 L - | 292 - V
135 K - | 293 - G
141 N T | 294 F -
145 V - | 295 I -
146 - A | 297 F L,M
147 - K | 298 E -
149 E - | 306 V E
150 G - | 307 E -
154 I,V - | 308 T -
159 - I,V | 317 A -
161 G N | 318 M -
163 - A | 319 S -
165 - D | 320 K -
166 - G | 321 Q G
167 - L | 322 S -
168 - G |
|
