Учебный сайт
Главная Семестры Проекты Обо мне

Элемент вторичной структуры белка BCCP

Белок принадлежит к бета-типу, все его вторичные структуры являются бета-тяжами. Для рассмотрения строения и взаимодействия вторичных структур выберем 2 антипараллельных бета-тяжа:
2 антипараллельных бета-тяжа в картонной модели2 антипараллельных бета-тяжа в остовной модели
Рассмотрим 2 бета-тяжа отдельно от белковой цепи. Между ними существуют водородные связи, поддерживающие стабильность цепи. На рисунке изображены в шарнирной модели бета-тяжи(атомы азота синие, атомы кислорода красные) и желтым цветом показаны водородные связи:
2 бета-тяжа в шарнирной модели
По изображенной структуре можно определить правило, по которому образуется связь между антипараллельными бета-тяжами. Водородные взаимодействия возникают при связывании N116 - O127 O116 - N127; N118 - O125 O118 - N125; N120 - O123 O120 - N123, т.е. Nx - Oy Ox - Ny; Nx+2 - Oy-2 Ox+2 - Ny-2. Также в одной из цепей возможно возникновение водородных связей между атомами Ox - Nx+2.

© Яшина 2009