Второй семестр

Отчет за первый блок

• Белок beta-lactamase precursor в банках Swiss-Prot и TrEMBL
• Работа с системой SRS
  Работа с системой SRS (.doc-файл)
• Выравнивание вручную
• Матрицы замен

Отчет за второй блок

• Матрицы переходов глобального и локального выравнивания
• Программы построения выравниваний
• Работа с программой BLAST

Отчет за третий блок

• Сравнение фрагмента полного множественного выравнивания, полученного с помощью программы ClustalW, с соответствующим фрагментом "эталонного" выравнивания из SMART
• Поиск по паттерну в банке Swiss-Prot
• Мотивы в белке ampC_ECOLI, описанные в БД Prosite
• Доменная структура белка ampC_ECOLI
• Отчет по работе с БД InterPro
• Работа с PSI-BLAST
• Филогенетические деревья, реконструированные разными способами