Мотивы в белке AMPC_ECOLI, описанные в БД Prosite

Второй семестр На главную
ClustalW и SMART Поиск по паттерну Мотивы в белке ampC_ECOLI Доменная структура Работа с БД InterPro PSI-BLAST Tree
Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN Сайт присоединения прокариотических мембранных липопотеиновых липидов Паттерн {DERK}(6) - [LIVMFWSTAG](2) - [LIVMFYSTAGCQ] - [AGS] - C Специфична 1
PS00336 BETA_LACTAMASE_C Активный сайт бета-лактамазы класса "С" Паттерн [FY] - E - [LIVM] - G - S - [LIVMG] - [SA] - K Специфична 1
PS00008 MYRISTYL Сайт N-миристоилирования Паттерн G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} Неспецифична 12
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования казеин киназы II Паттерн [ST] - x(2) - [DE] Неспецифична 9
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования С протеин киназы Паттерн [ST] - x - [RK] Неспецифична 3
PS00001 ASN_GLYCOSYLATION N-сайт глюкозилации Паттерн N - {P} - [ST] - {P} Неспецифична 3

Данная таблица описывает мотивы моего белка, найденные в БД Prosite.
Мы нашли все паттерны и профили, соответствующих моему белку, результатом чего явился список подписей.
Специфичных найдены 2 подписи, а неспецифичных - 14.
©Виктор Соколов