Выравнивание вручную

Второй семестр На главную
Белок в банках данных Работа с SRS Выравнивание вручную Матрицы замен

Выравнивание последовательностииз 60 первых аминокислот моего белка и предложенной последовательности:

Работу по вычислению веса можно скачать тут.

Вычисление веса:

W=? - вес выравнивания.
M=53 - число позиций выравнивания, в которых обе буквы одинаковы.
X=7 - число позиций выравнивания, в которых буквы разные.
G=29 - число гэпов.

W=M-X-G;
W=17.

Выравнивание двух последовательностей:

Выравнивались последовательности белков beta-lactamase precursor, принадлежащие организмам Escherichia Coli и Yersinia pestis.
Вот ссылка на документ, содержащий выравненные последовательности.
©Виктор Соколов