Выравнивание вручную
Выравнивание последовательностииз 60 первых аминокислот моего белка и предложенной последовательности:
Работу по вычислению веса можно скачать тут.
Вычисление веса:
W=? - вес выравнивания.
M=53 - число позиций выравнивания, в которых обе буквы одинаковы.
X=7 - число позиций выравнивания, в которых буквы разные.
G=29 - число гэпов.
W=M-X-G;
W=17.
Выравнивание двух последовательностей:
Выравнивались последовательности белков beta-lactamase precursor, принадлежащие организмам Escherichia Coli и Yersinia pestis.
Вот ссылка на документ, содержащий выравненные последовательности.
©Виктор Соколов