Шестой семестр

Мои контакты:

kodomo.fbb.msu.ru
olya_zol@inbox.ru
я вконтакте

Мои результаты:

Первый Семестр
Второй Семестр
Третий Семестр
Четвертый Семестр

Шестой Семестр

Молекулярное моделирование биополимеров

1. Работа в Pymol
   1. Знакомство с Pymol
   2. Работа в Pymol
   
   
2. Cеми-эмпирические вычисления
   3. MOPAC
   
   
3. Вычисления ab inito
   4. Ab initio вычисления для нафталина и азулена
   
   
4. Вычисление параметров для молекулярной механики
   5. Вычисление параметров для валентных углов
   6. Вычисление точных зарядов и VdW параметров
   7. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS
   
   
5. 
   8-9. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS GROMACS
   10. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
   11. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка
   12. Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка.
   13. Рассчёт энергии сольватаци димера этилен-гликоля методом FEP.