На главную страницу Term2

Второй семестр.

Результаты упражнений.

Блок 1

  1. Белок AMPA_ECOLI в банках Swiss-Prot и TrEMBL.
  2. Работа с системой SRS.
  3. Выравнивание вручную.
  4. Матрицы замен.

Блок 2

  1. Матрицы переходов глобального и локального выравнивания.
  2. Программы построения выравниваний.
  3. Работа с программой BLAST.

Блок 3

  1. Сравнение фрагмента полного множественного выравнивания, полученного с помощью программы ClustalW, с соответствующим фрагментом " эталонного" выравнивания из SMART.
  2. Поиск по паттерну в банке Swiss-Prot.
  3. Мотивы в белке AMPA_ECOLI, описанные в БД Prosite.
  4. Поиск доменов в белке AMPA_ECOLI с помощью Pfam.
  5. Поиск доменов в белке AMPA_ECOLI с помощью InterPro.
  6. Поиск гомологов белка LGB1_LUPLU с помошью PSI-BLAST.
  7. Филогенетические деревья, реконструированные разными способами.
©Попенко Анна