На главную страницу второго семестра SwissProt and TrEMBL

Белок AMPA_ECOLI в банках Swiss-Prot и TrEMBL.

Таблица поиска в SwissProt.

 

Метка поля

Содержание

Код доступа ("Accession number")  AC  P11648
Идентификатор последовательности в БД  ID  AMPA_ECOLI
Название (краткое описание) белка  DE  Cytosol aminopeptidase
Дата создания документа  DT  21 декабря 2004г.
Дата последнего исправления аннотации  DT  7 февраля 2006г.
Название организма  OS  Escherichia coli
Полное название таксона  OC  Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательности  SQ  503 a.o.
Молекулярная масса белка  SQ  54880
Число публикаций, использованных при создании документа  RN  5 публикаций
Название журнала с самой свежей публикацией  RL  EMBO J.
Описание вторичной структуры  FT Описания вторичной структуры имеется. Оно состоит из описания расположения альфа-спиралей и бета-листов, ионов металлов и активных сайтов.
Что содержит поле комментариев?  CC 1.Функция - вовлечен в регуляцию внутриклеточных белков.
2.Каталитическая активность - катлизирует выведение N-терминальные аминокислот.
3.Кофактор - соединяет по 2 иона магния в каждой субъединице.
4.Ферментная регуляция - ингибируется цинком и EDTA.
5.Субъединицы - гексамер.
6.Родство - принадлежит роду пептидаз М17.
Какие особенности последовательности указаны?  FT 1. Длина 1 цепи - 503 а.о.
2. Потенциальные активные сайты а.о. 282 и 356
3. В состав белка входит металл - магний
Идентификаторы записей PDB  DR 1GYT 

Результаты поиска.

 Запрос Число документов
в SwissProt
Число документов
в TrEMBL
 pepA 142 112
 Cytosol aminopeptidase 118 114
 b4260 1 6


©Попенко Анна