На главную страницу второго семестра Global and local alignment.

Матрицы переходов глобального и локального выравнивания.

На странице global нижеприведенного файла находится таблица перехода глобального выравнивания 2х последовательностей. Первая, по горизонтали, была взята из белка AMPA_ECOLI. Вторая, по вертикали, была создана путем замены 2го и 4го аминокислотного остатка и добавлением 5го. В резульате, вес выравнивания, соответствующего оптимальному пути, оказался равен нулю, чего и следовало ожидать.

На станице local того же файла приведена таблица локального выравнивания тех же последовательностей. Выравнивания оказались достаточно похожими, так что путь выравнивания совпал. Вес выравнивания составил 3.
Матрицы переходов глобального и локального выравнивания.


©Попенко Анна