Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2011

Семестр VII. Биоинформатика структур

Результаты (прим. Результаты контрольной по укладкам - см. P:\y11\Term_7\cw3d_results.xlsx )

Расписание

Доп. тексты для подготовки к экзамену см. на диске P ... y11/term7/...


Записаться на проверку

Состояние очереди


Новости

В среду 24 дек в 10:00 состоится неофициальный зачет.

В зачёт входит:

  • РСА (с оценкой)
  • отчёт по качеству расшифровки структуры
  • доклад на журнальном клубе + реферат (с оценкой)
  • зачёт умений (см. ведомость)

Если тема не сдана, то она переходит на экзамен.

При соотв. результатах получение пятерки за экзамен автоматом не исключается!

25 нояб. Это не новость, а сообщение. В экзаменационных билетах будут вопросы по докладам на журнальном клубе.


Экзамен


Актуальные задания

26 нояб

Демонстрация умений

[ умения ] [ задания ] [ укладки и мотивы ]

Журнальный клуб

[ темы ] [ про реферат ]

Отчёт по расшифровке структуры

[ отчёт по своей структуре ] [ указания ]


Блок 1: Основы рентгеноструктурного анализа

Лекция 1. Кристаллография макромолекул, часть 1

1 окт 2014

В.Ю. Лунин

[ презентация, вариант этого года ] [ текст к прошлогодней презентации ]

Занятие 1. Электронная плотность. Рассеяние на электроне.

2 окт 2014

А.Алексеевский

[ задание ] [ инструкции по pymol ] [ разъяснение об ЭП ]

Замечания по результатам проверки: типичные недостатки

Лекция 2. Кристаллография макромолекул, часть 2

8 окт 2014

В.Ю.Лунин

[ презентация, вариант этого года ] [ текст к прошлогодней презентации ]

Занятие 2. Восстановление окружения молекулы белка в кристалле. Ряд Фурье функции электронной плотности (одномерная модель)

9 окт 2014

А.Алексеевский, С.Спирин

[ задания ] [ pymol: подсказки ] [ "официальный" help ]

Занятие 3. Ряд Фурье функции электронной плотности

15 окт 2014

А.Алексеевский, С.Спирин

[ задание по восстановлению функции из пр.2 ]

Лекция 3. Водородные связи и вторичная структура белков. Алгоритмы DSSP и Stride.

16 окт 2014

С.А. Спирин

[ презентация ]

Лекция 4. Кристаллография макромолекул, часть 3

22 окт 2014

В.Ю.Лунин

[ презентация, вариант этого года ] [ текст к прошлогодней презентации ]

Занятие 4. Разрешение структуры

23 окт 2014

А.Алексеевский, С.Спирин

[ задание, входящее в отчет по анализу структур ]

Лекция 5. Оценка качества 3D структуры

29 окт 2014

А.В.Алексеевский

[ презентация ]

Занятие 5.

30 окт 2014

А.Алексеевский, С.Спирин

[ задания ]

Лекция 6. ЯМР. Многомодельные PDB-файлы

5 ноября 2014

С.А.Спирин

[ презентация ]

Занятие 6.

6 ноября 2014

А.Алексеевский, С.Спирин

[ задания ] [ указания ]

Лекция 6. Пространственное совмещение

13 ноября 2014

Е.А. Аксянов

[ презентация ]

Лекция 7. Гидрофобные кластеры. Структурные домены

19 ноября 2014

А. Алексеевский

[ 1-кластеры ] [ 2-домены ]

Лекция 8. Структурные домены (окончание). Поверхность молекулы

20 ноября 2014

С. Спирин

[ 2-домены ] [ 3-поверхность ]

Лекции 9-10. Архитектура и топология. Структурные классификации

26-27 ноября 2014

Е. Аксянов

[ презентация ]

[ Контрольная по укладкам и мотивам]

(прим. Результаты контрольной по укладкам - см. P:\y11\Term_7\cw3d_results.xlsx )

Задания на будущее

[ отчёт по своей структуре ] [ указания ]

[ Вопросы к коллоквиуму ]

Журнальный клуб

[ темы ]

2011/7 (последним исправлял пользователь tuser 2014-12-25 07:41:30)