учебный сайт Вероники Владыкиной

Во втором семестре мы:

1. познакомились с записью в UniProt и поиском в SwissProt.
2. сравнили различные поисковые системы : UniProt, MRS,SRS. Научились оформлять различные поисковые запросы в системе SRS.
   
3. закончили первый блок, в результате чего выполнили зачетное задание , посвященное ему
4. еще лучше познакомились с поиском в PubMed
5. узнали что такое выравнивание и сделали несколько пробных выравниваний с помощью программы GeneDoc
6. узнали, что бывают глобальные и локальные выравнивания , и чем они отличаются. Помимо этого поработали в Linux
7. Впервые увидели очень полезный BLUST protein. Познакомились с его интерфейсом и немного в нем поработали. Сравнили выравнивания BLUST с выравниваниями needle и water.
8. Составили выравнивание последовательностей по известному пространственному выравниванию и сравнили его с предложенным needle
9. Узнали, что бывает еще и множественное выравнивание. Познакомились с некоторыми программами, которые его составляют и несколькими программами обработки полученных выравниваний.
10. Узнали, что такое паттерны и профили. Попробовали посоставлять паттерны по множественному выравниванию. Посмотрели какие профили и паттерны встречаются в наших белках
11. Познакомились с PSI-BLAST и немого в нем поработали с разными белками