Описание пространственной структуры beta-lactamase precursor (предшественника бета-лактамазы) по данным банка PDB, код 1my8

Первый семестр На главную
Общие сведения о белке 3D-структура белка Описание вторичной структуры Описание области контакта белка с лигандом Трипептид Результаты поиска: desulfovibrio vulgaris Результаты поиска: ostreococcus tauri

Chain A и Chain B - полипептидные цепи белка ampC. Они выделены соответственно красным и синим цветами.
BETA-LACTAMASE PRECURSOR - полное название белка.
SM3 - лиганд, выделен зеленым. В цепи B, лиганд SM3 имеется только в одной конформации. Но в цепи A лиганд имеет две конформации - A и B, что и показано на рисунке.
Желтыми стрелками выделены бета-листы белка.
Скрипт: 
background black
wireframe off
trace 60
select *A
color red
select *B
color blue
select [SM3]
color green
wireframe on
select sheet
color yellow
cartoons on
select trp142a.ca
label AMPC BETA-LACTAMASE
select pro347a.ca
label Chain A
select asp242b.ca
label Chain B
select *b.B
label SM3 Chain B
select *a.sad;a
label SM3;A Chain A
select *a.oao;b
label SM3;B Chain B
set fontsize 10
color label greenblue
Этот скрипт нужен для получения изображения 3D-структуры белка.

©Виктор Соколов