Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2009

Практические занятия к курсу "Молекулярное Моделирование Биополимеров"

Правила сдачи зачёта

Связи с тем, что практикум предполагает использование суперкомпьютера и время доступа ограничено, то ожидается, что к этому моменту студенты будут знакомы с азами. Для достижения этого результата необходим контроль за исполнением заданий. Итак:

Жду рациональных предложений.


Результаты

Оценки вы можете найти по ссылке, которая пришла к Вам на 2009fbb@gmail.com.
Как я понимаю, большинство не поняло, что надо сменить пользователя в gmail для просмотра документа. Так вот, для просмотра смените пользователя gmail на 2009fbb, и не надо слать мне запросы на share.




1. Знакомство с Pymol

8 февраля 2012, А.В.Головин, А. Гришин. [задания] [презентация]


2. Работа Pymol

15 февраля 2012, А.В.Головин, А. Гришин. [задания] [подсказки]


3. Cеми-эмпирические вычисления: Mopac

22 февраля 2012, А.В.Головин, А. Гришин. [задания]


4. Abinitio вычисления для нафталина и азулена

29 февраля 2012, А.В.Головин, А. Гришин. [задания]


5. Вычисление валентных параметров для молекулярной механики

7 марта 2012, А.В.Головин, А. Гришин. [задания]


6. Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики

14 марта 2012, А.В.Головин, А. Гришин. [задания]


7. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS

21 марта 2012, А.В.Головин, А. Гришин. [задания]


8. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS

28 марта 2012, А.В. Головин, А. Гришин [задания]


9. Анализ молекулярной динамики биологических молекул в GROMACS

4 апреля 2012, А.В. Головин, А. Гришин [задания]


10. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом

11 апреля 2012, А.В. Головин, А. Гришин [задания]


11. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка

18 апреля 2012, А.В. Головин, А. Гришин [задания]


12. Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка.

25 апреля 2012, А. Гришин, А.В. Головин [задания]


13. Расчёт энергии сольватаци димера из двух мономеров полиэтиленгликоля методом FEP.

2 мая 2012, А. Гришин, А.В. Головин [задания]

2009/6/Modelling (последним исправлял пользователь golovin 2012-05-02 13:34:22)