Второй семестр.

Результаты упражнений, проделанных за семестр.

1. Первый блок.
   • Белок BIOD_ECOLI в банках Swiss-Prot и TrEMBL
   • Работа с системой SRS
   • Выравнивание вручную.
   • Матрицы замен.
   
   

   
   

2. Второй блок.
   • Матрицы переходов глобального и локального выравниваний
   • Программы выравнивания
   • Работа с программой BLAST
3. Третий блок.
   • Сравнение фрагмента полного множественного выравнивания, полученного с помощью программы ClustalW, с соответствующим фрагментом "эталонного" выравнивания из Pfam
   • Поиск по паттерну в банке Swiss-Prot
   • Мотивы в белке GLMS_ECOLI, описанные в базе данных PROSITE
   • Отчет по работе с базой данных Pfam
   • Отчет по работе с базой данных InterPro
   • Отчет по работе с PSI-BLAST
   • Первое знакомство с филогенетическими деревьями