Молекулярное моделирование биополимеров

1. Знакомство с PyMOL
2. Работа с PyMOL
3. Cеми-эмпирические вычисления: Mopac
4. Abinitio вычисления для нафталина и азулена
5. Вычисление параметров для молекулярной механики
6. Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики
7. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS
8. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS
9. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
10. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка
11. Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка
12. Расчёт энергии сольватации димера из двух мономеров полиэтиленгликоля методом FEP.

Hа Главную
Kodomo Home