Второй семестр

• Общие принципы сравнения последовательностей.

  • Банки данных Swiss-Prot и UniProt

• Выравнивание

  • Матрицы весов аминокислотных замен
  • Глобальное и локальное выравнивание аминокислотных последовательностей
  • Контрольная работа за второй блок

• Семейства белков

  • Консервативные аминокислотные остатки потенциальных ортологов TRUB_ECOLI
  • Данные Pfam о белке TRUB_ECOLI
  • Данные InterPro о белке TRUB_ECOLI
  • Сравнение множественного выравнивания, полученного с помощью программы Clustalw, с "биологически правильным" выравниванием из BaliBase
  • Паттерны белка TRUB_ECOLI
  • Работа с PSI-Blastом
  • Деревья

© Армаш Татьяна,2005