На главную страницу второго семестра Банки данных Swiss-Prot и UniProt

Данные банка Swiss-Prot о белке TRUB_ECOLI

TRUB_ECOLI Метка поля(line code) Запись
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P60340; P09171; P76671
Стандартное имя последовательности(идентификатор последовательности) ID TRUB_ECOLI
Название белка, отражающее его функции DE тРНК-псевдоуридинсинтетаза
Дата создания документа DT 01-MAR-1989 (Rel. 10, Created)
01-MAR-1989 (Rel. 10, Created) DT 25-JAN-2005 (Rel. 46, Last annotation update)
Название организма OS Escherichia coli.
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательности ID, SQ 314 а. о.
Молекулярная масса белка SQ 35087 а. е. м.
Число публикаций, использованных при создании документа RN 8
Название журнала с самой свежей публикацией RL Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
Описание вторичной структуры FT Здесь указаны номера аминокислотных остатков, формирующих альфа-цепи и бета-тяжи, а также номера аминокислотных остатков, расположенных в месте изгиба полипептидной цепи.
Что содержит поле комментариев? CC Информация о функции, каталитической активности, сходстве
Какие особенности последовательности указаны? FT Указаны номера аминокислотных остатков, в которых произошла мутация, номера аминокислотных остатков, формирующих альфа-цепи и бета-тяжи, а также номера аминокислотных остатков, расположенных в месте изгиба полипептидной цепи.
Идентификатор файла PDB DR 1K8W; 1R3F

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка TRUB_ECOLI

Таксон Запрос Количество найденных документов
Археи(Archaea) "([uniprot-Taxonomy:Archaea*] & (((([uniprot-Description:tRNA*] & [uniprot-Description:pseudouridine*]) & [uniprot-Description:synthase*]) & [uniprot-Description:B]) | [uniprot-Description:tRNA pseudouridine synthase B*])) " 2
Бактерии(Bacteria) "([uniprot-Taxonomy:Bacteria*] & (((([uniprot-Description:tRNA*] & [uniprot-Description:pseudouridine*]) & [uniprot-Description:synthase*]) & [uniprot-Description:B]) | [uniprot-Description:tRNA pseudouridine synthase B*]))" 29
Эукариоты(Eukaryota) "([uniprot-Taxonomy:Eukaryota*] & (([uniprot-Description:Pseudouridylate*] & [uniprot-Description:synthase*]) | [uniprot-Description:Pseudouridylate synthase*]))" 32

На главную страницу второго семестра


© Армаш Татьяна,2005