Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2014

Восстановление кристалла из PDB файла

Технические подсказки см. здесь.

1. В структуре "своего" белка опишите взаимодействия с белками из соседних ячеек

В отчете приведите:

2. Объясните странное расположение белковых цепей в структуре ДНК-белкового комплекса

3. Приведите два примера PDB файлов, асимметрическая единицы которых не совпадает с биологической единицей

В отчете напишите в чем разница и приведите рис. содержимого асимметрических единиц и биологических единиц.

Можно воспользоваться advanced search в PDB по полям number of chains (asymm. unit) и number of chains (Biol. assembly) - они должны различаться.