Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2014

Семестр 7. Биоинформатика 3D структур

Расписание

Экзамен

См. здесь

Блок 1. РСА

1. Лекция 1

4 октября 2017, В.Ю. Лунин

[презентация]

2. Семинар 1

6 октября 2017, А.В. Алексеевский, С.А.Спирин

[задание 1 (электронная плотность в PyMol)]

3. Лекция 2

11 октября 2017, В.Ю. Лунин

[презентация]

4. Семинар 2

13 октября 2017, А.В. Алексеевский, С.А.Спирин

[задание 2 (восстановление кристалла в PyMol)]

5. Лекция 3

18 октября 2017, В.Ю. Лунин

[презентация]

6. Семинар 3

20 октября 2017, А.В. Алексеевский, С.А.Спирин

[задание 3 (разложение функции в ряд Фурье)]

7. Лекция 4. Немного о ЯМР

25 октября 2017, С.А. Спирин

[презентация] [задание 4 (анализ ЯМР-файла)]

8. Лекция 5. Показатели качества РСА-модели

27 октября 2017, А.В. Алексеевский

[презентация] [Отчёт по validation]

По просьбе трудящизся дедлайн для отчёта отодвинут на 6 декабря, утро.

9. Лекция 6. Локальные показатели качества РСА-модели (окончание лекции 5)

1 ноября 2017, А.В. Алексеевский

10. Консультация к коллоквиуму

3 ноября 2017, А.В. Алексеевский, С.А. Спирин

Вопросы к коллоквиуму

11. Коллоквиум

8 ноября 2017, А.В. Алексеевский, С.А. Спирин, И.С. Русинов, А.О.Залевский, Д.Д.Пензар

Блок 2. Основные методы анализа структур

12. Лекция 7. Разметка вторичной структуры

10 ноября 2017, С.А.Спирин

[презентация] [задание]

13. Лекция 8. Гидрофобные ядра, выделение доменов

15 ноября 2017, С.А.Спирин

[презентация (г/ф ядра)] [презентация (домены)]

[задание]

14. Лекция 9. Поверхность макромолекулы, классификация доменов

17 ноября 2017, С.А.Спирин

[презентация (поверхность)] [презентация (классификация)]

[задание]

15. Лекция 10. Пространственное выравнивание и совмещение структур

22 ноября 2017, А.О.Залевский

[презентация] [задание]

Дедлайн для заданий этого блока — начало зачётной недели (25 декабря).

Блок 3. Журнальный клуб

[правила] [темы для выбора] [расписание]