учебный сайт Вероники Владыкиной

Описание бактерии Candidatus Blochmannia и её протеома.

отчет Вероники Владыкиной

Введение

Вид C.Blochmannia относят к роду Candidatus, подсемейство ant endosymbionts, семейство Enterobacteriaceae, порядок Enterobacteriales, домен Gammaproteobacteria, филум Proteobacteria, царство Bacteria

C.Blochmannia - эндосимбионты в клетках семянников самца муравья, положение бактерий укказно стрелками(фото под электронным микроскопом). фото взято с http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=124124&rendertype=figure&id=f6

Обитает в клетках муравьёв (Camponotus floridanus)

Представляет интерес именно как эндосимбионт. Ее геном был сиквенирован и сравнён с геномом свободноживущей бактерии (E.Coli), чтобы понять как бактерии приспособились к внутриклеточному образу жизни.

Для поиска на PubMed статей, посвящённых C.Blochmannia, выпущенных не позднее 2003 года был сформулирован запрос "Candidatus Blochmannia 2003:2008[dp]". По этому запросу было найдено 2 статьи.Так же были найдены 2 статьи, посвящённые C.Blochmannia в открытом доступе.

Геном C.Blochmannia

Candidatus Blochmannia floridanus, complete genome. Accession: NC_005061. Length: 705,557 bp взято с сайта http://wishart.biology.ualberta.ca/BacMap/graphs_cgview.html

Статистические данные о протеоме C.Blochmannia взяты с сайта http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html

Название компоненты	число белков	тип	длина (нп)	средняя длина CDS	содержание GC	Суммарная длина генов (% от длины хромосомы или плазмиды)	Число генов
хромосома	610	кольцеваятип	791654 (нп)	995.331	29.6%	77%	610

Литература

1. www.ebi.ac.uk
2. http://mic.sgmjournals.org/cgi/reprint/148/8/2551.pdf
3. www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14965905?ordinalpos=2&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_DefaultReportPanel.Pubmed_RVDocSum
4. www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12200264?ordinalpos=3&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_DefaultReportPanel.Pubmed_RVDocSum

протокол проекта