Примеры разных контактов в молекуле белка 1IE0_Bacsu.
Пример гидрофобного контакта.
74-ый остаток фенилаланина представлен в шарнирной модели,
контактирующие с ним а.о - в проволочной модели, а их непосредственно контактирующие атомы в виде шариковой модели.Все атомы раскрашены по химическим элементам.
Примеры водородных связей между боковыми группами.
Донором и акцептором водорода являются атомы азота.
На рисунке изображены 58ой и 54ый остатки гистидина.Предположительно имеется водородная связь между их NE2 атомами.
Донором и акцептором водорода являются атомы кислорода.
На рисунке изображены 18ый остаток тирозина и 37ой остаток аспарагина.Предположительно имеется водородная связь между OD2 атомом аспарагина и OH атомом тирозина.
Пример дисульфидного мостика в молекуле инсулина.
В белке LUXS_Bascu дисульфидных мостиков нет.Поэтому привожу пример дисульфидного мостика в молекуле инсулина.
Дисульфидный мостик замыкается между атомами серы 19ого остатка цистеина цепи B и 20ого остатка цепи A.