Эволюционная модель.

В последовательность гена TpiS были внесены были внесены случайные мутации программой msbar пакета emboss, в соответствии с деревом эволюции изображенным на рисунке 2.
Дерево, построенное согласно скобочной структуре (рис1): ( A:100, (B:80, (((C:20,D:20):10, E:30):30, F:40):20):20 ); Расстояния приведены в заменах на 100 нуклеотидов	Дерево, построенное с пересчетом нуклеотидных замен на полную длинну последовательности гена (рис2):
В данном рисунке обнаружена ошибка: расстояние между ветвью B и ветвью F равняется 20, а не 40, как было указано, т.к значение 40 не удовлетворяет алгоритму построение дерева.
Скрипт, поданный в программу msbar:
msbar p04790.embl a.embl -point 4 -count 767 -auto msbar p04790.embl mb1.embl -point 4 -count 153 -auto msbar mb1.embl mb.embl -point 4 -count 614 -auto msbar mb1.embl mf1.embl -point 4 -count 307 -auto msbar mf1.embl m1.embl -point 4 -count 307 -auto msbar mf1.embl me1.embl -point 4 -count 230 -auto msbar me1.embl me.embl -point 4 -count 230 -auto msbar me1.embl md1.embl -point 4 -count 77 -auto msbar md1.embl md.embl -point 4 -count 153 -auto msbar md1.embl mc.embl -point 4 -count 153 -auto
Анализ модели: Определение эволюционного расстояния между нуклеотидными последовательностями Сравнение методов реконструкции деревьев