1. Введение в PyMOL
2. Cеми-эмпирические вычисления: Mopac
3. Abinitio вычисления для нафталина и азулена
4. Вычисление параметров для молекулярной механики
5. Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики
6. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS
7-8. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS
9. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
10. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка
