Исследование пространственной структуры белка FadR
Работа с помощью программы RasMol
Структурный вид:
Данный белок
имеет одну полипептидную цепь, имеется
лиганд - MYRISTOYL-COA.
Форма белка – две цилиндрических
глобулы (одна чуть меньше другой),
соединённых узким цилиндрическим
переходом.
Схематическое описание:
Характерные размеры:
Радиус меньшей глобулы-13,49 Å : PRO8A.CA-LEU37A.CA
Радиус большей глобулы-16,46Å: TRP223A.CH-HIS137A.CB
Диаметр перехода-20,32 Å: LEU80A.CG-HOH66Z.O
Высота меньшей глобулы-34,24 Å: ARG35A.NH-GLU76A.CB
Высота большей глобулы-37,77 Å: ASP122A.OD-HIS178A.CE
Длина перехода-19,63 Å: LEU89A.CD-HOH108Z.O
Карта Рамачандрана
Описание фрагмента вторичной структуры
Топология домена
Контакты с лигандом