Карта Рамачандрана

 Работа с программами: Exel, RasMol

Область наиболее плотного сгущения: -80<φ<-50, -60<ψ<-20

Самый длинный участок - с 183 по 201 остатки

-70,3<φ<-59,2; -49,2<ψ<-28,4

Средние значения: φ=-64,75; ψ=-38,85

Отклонение по φ: 5,55; по ψ: 10,85

φ=-64,75±5,55; ψ=-38,85±10,35

Этот фрагмент выглядит как практически правильная правозакрученная спираль (явная альфа-спираль) 

Других крупных областей сгущения на карте Рамачандрана нет.

№ остатка Цепь Остаток φ
23  A  N 73,9
28  A  G 93,3
42  A  G 90,4
59  A  G 83,5
66  A  G 70
90  A  D 62,6
157  A  G 93,1
203  A  G 60,2
227  A  Q 58,4

Вывод: остатков с φ, большими 0, очень мало (порядка 5% от общего числа), причём абсолютное большинство составляет глицин. Очевидно, эти остатки образуют переходы между упорядоченными элементами вторичной структуры, глицина же много потому, что у него самый маленький боковой остаток, не затрудняющий вращение вокруг N-CA и C-CA-связей.

на главную