Карта Рамачандрана
Работа с программами: Exel, RasMol
Область наиболее плотного сгущения: -80<φ<-50, -60<ψ<-20
Самый длинный участок - с 183 по 201 остатки
-70,3<φ<-59,2; -49,2<ψ<-28,4
Средние значения: φ=-64,75; ψ=-38,85
Отклонение по φ: 5,55; по ψ: 10,85
φ=-64,75±5,55; ψ=-38,85±10,35
Этот фрагмент выглядит как практически правильная правозакрученная спираль (явная альфа-спираль)
Других крупных областей сгущения на карте Рамачандрана нет.
№ остатка | Цепь | Остаток | φ |
23 | A | N | 73,9 |
28 | A | G | 93,3 |
42 | A | G | 90,4 |
59 | A | G | 83,5 |
66 | A | G | 70 |
90 | A | D | 62,6 |
157 | A | G | 93,1 |
203 | A | G | 60,2 |
227 | A | Q | 58,4 |
Вывод: остатков с φ, большими 0, очень мало (порядка 5% от общего числа), причём абсолютное большинство составляет глицин. Очевидно, эти остатки образуют переходы между упорядоченными элементами вторичной структуры, глицина же много потому, что у него самый маленький боковой остаток, не затрудняющий вращение вокруг N-CA и C-CA-связей.