Банк EMBL

Сравнение разных записей в EMBL

C помощью SRS получена информация, необходимая для заполнения таблицы. Записей оказалось всего три.

EMBL	ID	Molecule	Class	Division	SeqLength	DateCreated	Description
EMBL:U00096	U00096	genomic DNA	STD	PRO	4639675	23-FEB-2006	Escherichia coli K12 MG1655, complete genome.
EMBL:AP009048	AP009048	genomic DNA	STD	PRO	4646332	22-JAN-2006	Escherichia coli W3110 DNA, complete genome.
EMBL:M88334	M88334	genomic DNA	STD	PRO	5378	16-MAR-1992	Escherichia coli succinic semialdehyde dehydrogenase (gabD), GABA transaminase (gabT), and GABA permease (gabP) genes, complete cds.

Сравнение характеристик разных записей:
Две из трех записей относятся к полному геному E.coli, они датируются 2006 годом. Самая же ранняя запись (1992) относится к генам, кодирующим белок gabD, gabT и gabP. Соответственно, длина последовательности наименьшая.

Сравнение описаний гена Escherichia coli в двух разных записях EMBL

Последовательности, кодирующие белок gabT в двух записях банка EMBL

Знакомство с записью гена из эукариотического генома

• Схема структуры транслируемых участков указанного гена (AIF1) (изображен только первый и последний транслируемые участки).

  Ген на комплементарной цепи

      <-[328665..328689]--...--[327119..327203]----
  

  общее число экзонов в гене	самый длинный интрон	самый короткий интрон	самый длинный экзон	самый короткий экзон
  6	557	216	163	25

  
    Файл с расчетами - length.xls