Работа в базе данных Prosite.
Поиск мотивов в последовательности TrpC_Ecoli с помощью средств PROSITE.
В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов. Они описаны с помощью паттерна - для сайтов
- или профиля PSSM.
С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) были найдено 25 известных мотивов
в последовательности индол-3-глицерол фосфат синтетазы
* - отметьте часто встречающиеся в белках мотивы.
Для анализа я возьму такой паттерн: [LIVMFY]-[LIVMC]-x-E-[LIVMFYC]-K-[KRSP]-[STAHKR]-S-P-[ST]-x(3)- [LIVMFYST].
Ему может соответствовать такая последовательность: MCGEFKRASPTVSCM.