1. Prosite - первая, в своем роде, база данных, в которой содержатся биологически значимые сайты, паттерны и профили, т.е. те участки белка, которые могут нести какую-либо биологическую функцию.Документ Prosite может быть представлен либо в виде паттерна - для сайтов - или профиля PSSM (для мотивов, выводимых из большего числа последовательностей)
2. Pfam - база данных, в которой содержится большая коллекция множественных выравниваний, доменов, семейств и профилей-HMM для них. Она удобна для анализа доменной структуры белков.


3. InterPro - появился в 1999 году, это интегрированый ресурс белковых семейств, доменов и функциональных сайтов. Она содержит све документы таких баз данных как: Prosite, Pfam, ProDom и всех остальных подобных им.

1. Определить, какие известные мотивы есть в данной нам последовательности с помощью Prosite
2. Описать доменную структуру белка по данным взятым из Pfam.


3. Изучить документы интегрированной базы данных Interpro по даной структуре

Назад.

На главную страницу.