Сайт ~ Семестр I ~ Отчёт №4

Форма и размеры белка 1FG3 PDB

Общая форма: белок по общим контурам напоминает сильно упрощённый и схематизированный головной мозг позвоночного.

Для аппроксимации размеров белка за основу радиуса условной сферы взято расстояние между альфа-C-атомами аланина-186 и аспарагина-53, равняющееся 32,556 Å (ангстрем). Принят радиус в 32 Å. Объём сферы примерно равен 1,37 ų.

В цилиндре радиусом 0,5 μн и длиной 2 μн (общий объём -- примерно 1,57 μн³) можно разместить не более 1,44*10⁷ объектов такого размера.

В бактерии Escherichia coli среднего размера (того же объёма, что вышеупомянутый цилиндр), может поместиться не более 3281 объектов размером 1,37 ų каждого из 4400 видов.

Если условный радиус сферы белка равен 32 ангстрем, то на 1300-Å-линейку таких объектов поместится не более 20.

Наименьшая длина волны видимого света -- 380 нанометров. Чтобы выложить из данного белка линию такой длины, потребуется 60 отдельных молекул. Надо полагать, что для создания видимого под световым микроскопом объекта толщиной в одну молекулу придётся использовать не менее, чем 11 310 таких молекул.