Доменная структура белка DAPB_ECOLI

Доменная структура белка DABP_ECOLI

Доменная сруктура 3-D структура

На рисунке, отображающем 3D структуру, вы видите белок DAPB_ECOLI (PDB-код - 1arz)
Зеленое соответствует DABP_N (N концевой домен)
Красное соответствует DAPB_C (C концевой домен)





Поскольку 4 цепи идентичны, я рассматриваю только одну из них. (А)

Идентификатор Pfam
Название записи
Полное название домена
Положение в последовательности хххх_Ecoli
PF05173
DAPB_C
Терминал С Дигидродипиколинат редуктазы
132-269
PF01113
DAPB_N 
Терминал N Дигидродипиколинат редуктазы
6-129


Подробное описание домена PF01113

Описание семейства доменов, к которому относится N-концевой домен белка DAPB_ECOLI (домены только из PfamA).

  1. Дигидродипиколинат редуктаза (DAPB) редуцирует альфа, бета - сатурированные циклические имины и дигидродипиколинаты. Это второй шаг в биосинтезе L-лизина и его предшественника meso-diaminopimelate.
  2. Всего известно 288 белков с доменами DAPB_N
  3. В этих таксонах встречаются белки с таким доменом.
    Таксон
    Количество белков с доменом PF01113.
    Эукариоты Растения  8
    Грибы  1
    Животные  0
    Бактерии    267
    Археи    12

  4. чаще домен DAPB_N встречается в белках в сочетании с доменoм DAPB_C
    случаев дупликации домена DAPB_N нет
    случев перестановки 2-х доменов местами, если один из доменов DAPB_N нет