База данных промоутеров эукариот.

Общие сведения.

Исследуемая база данных - Eukaryotic Promotor Database.
Авторами данной базы данных, созданной сначала в научном институте Вайцмана города Реховот (Израиль) и в настоящее время поддерживаемой ISREC в Epalinges s/Lausanne (Швейцария) являются Philipp Bucher, Rouaida Cavin Perier, Viviane Praz и Christoph Schmid.
Последнее обновление производилось 13.04.2006 (release 86). Всего насчитывается 4809 записей, накопленные за 20 лет - такое сравнительно небольшое количество объясняется тем, что данные были получены экспериментально.

Пользовательские свойства стартовой страницы.

На стартовой странице есть поле быстрого поиска по АС, ID из данного БД.Рядом доступ к другим возможностям данного банка:

Поиск промоутеров эукариот
Загрузка последовательностей промоутеров
Сопоставление последовательностей BLAST и EPD(поиск промоутеров по аминокислотной последовательности)
Промоутерные элементы
Доступ к ftp-серверу: либо локально, либо через NCBI
Доступ к EPD через SRS

Также можно найти следующee:

Представлены ссылки на публикации по EPD, где можно почерпнуть дополнительную информацию - это статьи из PUBMED
База данных поддерживается Национальным Научным Фондом Swiss, web-интерфейс был поддержан грантом EC за сотрудничество с TRADAT
Внизу странички есть ссылки на другие базы данных сервера SIB-Lausanne

Описание поиска на данном сервисе.

Для того, чтобы произвести поиск в данном банке данных необходимо
пойти по ссылке: "Browse the Eukaryotic Promoter Database".
Поисковый аппарат сходен по интерфейсу с SRS. Из возможных вариантов
мы выбрали поиск по AC Swiss-prot. Но по причине того, что данный
банк данных намного меньше Swiss-prot'a, мы выбрали AC, для промоутера
которого существует запись в этой базе данных.

При поиске был получен следующий результат:

Запись в банке данных.

Мы решили воспользоваться другим сервисом:"BLAST sequences
against the EPD database", т.е. запустить Бласт по этой
базе данных. (Данная ссылка находится на главной странице)
Была взята часть последовательности из записи, упомянутой 
выше.

Результат запуска BLAST.

На главную страницу четвертого семестра