Содержимое страницы «Users/yiweitot/pr14». (Всем привет! Сегодня мы хотим поделиться <BR> результатами выполнения задания 14) <BR>

• (⊃｡•́‿•̀｡)⊃

⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀(Начнём с задания 1)

• ⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀눈_눈

Escherichia coli:
ATG 3890, GTG 338, TTG 80, ATT 4, TTC 1, CTG 2

Candidatus Gracilibacteria:
ATG 1129, GTG 41, TTG 23, TCA 1, ACA 1, TCT 1

Mycoplasmoides pneumoniae:
ATG 629, GTG 60, TTG 53, ATT 8, ATC 1, CTG 1, CTC 2, ATA 4, GGA 1, ACT 1, CAA 2, AAA 1, TTA 3, GTT 1, TCT 1, GAA 1

1)Иногда альтернативные старт-кодоны являются способом регуляции экспрессии генов.

2)Второй по встречаемости кодон GTG похож на ATG 

3) Может идти AUG-независимая трансляция

https://biomolecula.ru/articles/ran-transliatsiia-kogda-kodon-aug-ne-nuzhen

⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀(Задание 2)

• ⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀눈_눈

lcl|U00096.3_cds_b4587_250 [gene=insN] [locus_tag=b4587] [db_xref=ASAP:ABE-0285253,ECOCYC:G6130] [protein=IS911A regulator fragment] [pseudo=true] [location=join(270278..270540,271764..272190)] [gbkey=CDS]

lcl|U00096.3_cds_AAD13438.1_1459 [gene=fdnG] [locus_tag=b1474] [db_xref=UniProtKB/Swiss-Prot:P24183] [protein=formate dehydrogenase N subunit alpha] [transl_except=(pos:586..588,aa:Sec)] [protein_id=AAD13438.1] [location=1547401..1550448] [gbkey=CDS]

lcl|U00096.3_cds_AAD13456.1_3824 [gene=fdoG] [locus_tag=b3894] [db_xref=UniProtKB/Swiss-Prot:P32176] [protein=formate dehydrogenase O subunit alpha] [transl_except=(pos:586..588,aa:Sec)] [protein_id=AAD13456.1] [location=complement(4082772..4085822)] [gbkey=CDS]

lcl|U00096.3_cds_AAD13462.1_3997 [gene=fdhF] [locus_tag=b4079] [db_xref=UniProtKB/Swiss-Prot:P07658] [protein=formate dehydrogenase H] [transl_except=(pos:418..420,aa:Sec)] [protein_id=AAD13462.1] [location=complement(4297219..4299366)] [gbkey=CDS]

Первая последовательность - псевдоген. Стоп кодон находится не на последнем месте так как рамка считывания сбита из-за того, что этот псевдоген являются частью более крупной кодирующей последовательности.
fdnG - формиатдегидрогеназа N
fdoG - формиатдегидрогеназа O 
fdhF - формиатдегидрогеназа H
В них можно найти кодон TGA, который в данном случае не является стоп-кодоном, а кодирует селеноцистеин.

⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀(Задание 3)

• ⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀눈_눈

⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀(Задание 4)

• ⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀눈_눈

⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀

• ⠀⠀ ⠀(Задание 5)

• ⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀눈_눈

Кольцевые бактериальные хромосомы имеют сильно поляризованный нуклеотидный состав в двух репликонах, и эту асимметрию геномных цепей можно визуализировать с помощью графиков перекоса GC

(Программы, которые использовались для подсчётов вы сможете найти по этой ссылке https://colab.research.google.com/drive/1IOCUcxwNDoQwHtEGmDz3bDzqYWcSdwDi#scrollTo=lKihPtQHC

• (⊃｡•́‿•̀｡)⊃

⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀(Если что, то сделала всё я, а она

• просто очень хотела сказать хоть что-то кроме приветствия)

• ⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀ ⠀눈_눈

⠀ ТОТ!!!!

• ᕙ(⇀‸↼‶)ᕗ

⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀(Пока-пока, до новых встреч))

• ⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀⠀ ⠀눈‿눈