Киселёв Матвей

Студент ФББ МГУ

Электронная почта: <kiselevm AT SPAMFREE fbb DOT msu DOT ru>

= = = = = = = = = = = = = = =

Не то, что мните вы, природа:

Не слепок, не бездушный лик…

В ней есть душа, в ней есть свобода,

В ней есть любовь, в ней есть язык…

Ф. И. Тютчев

= = = = = = = = = = = = = = =

Про первое занятие

К моменту поступления я уже знал, что существуют программы, позволяющие предсказывать структуру белка по его последовательности. Однако, как известно, "повторение - мать учения"). И я рад, что смог услышать от профессионала краткий экскурс в область структурной биологии. Непонятных слов в лекции не встретилось, всё было понятно.

Отчёт о практикуме 3

https://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/Users/kiselevm/pr3

Отчёт о практикуме 7

https://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/Users/kiselevm/pr7

Отчёт о практикуме 8

https://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/Users/kiselevm/pr8

Отчёт о практикуме 12

https://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/Users/kiselevm/pr12

Отчёт о практикуме 13

Результаты выполнения практикума (Google-документ)

Shewanella baltica (Ziemke et al., 1998)

Бактериальный вид, выбранный мною для составления мини-обзора.

Страница с информацией про мини-обзор генома

Таксономическое положение вида [2]

Домен: Bacteria Woese et al., 1990

Тип: Proteobacteria Stackebrandt et al., 1986

Класс: Gammaproteobacteria Garrity et al., 2005

Отряд: Alteromonadales Bowman et MсМееkin, 2005

Семейство: Shewanellaceae Ivanova et al., 2004

Род: Shewanella МacDоnеll et Colwell, 1985

Биология

Грам-отрицательная короткая прямая палочка, подвижная за счёт полярно расположенных жгутиков. Факультативно анаэробный, но не способный к брожению вид. Каталазо- и оксидазоположительный. При культивировании на TSI-агаре образуется осадок FeS, что говорит о способности к продукции бактерией H₂S. Окисляя органические вещества, могут восстанавливать NO₃^-, Fe³⁺ и соединения серы. От близких видов Shewanella baltica отличается способностью расти при 4°C и остановке роста при 37°С, постоянной продукцией N-ацетил-β-глюкозаминидазы, а также отсутствием синтеза химотрипсина и способностью использовать гликоген, сахарозу, целлобиозу и некоторые другие вещества в качестве единственного источника энергии и углерода [1].

Исследования показали, что Shewanella baltica - главный образователь сероводорода на замороженной рыбе, выловленной в Балтийском море. При этом в микрофлоре живых рыб (трески, камбал) он играет минорную роль [2].

Литература

1) Ziemke F., Hofle M. G., Lalucat J., Rossello-Mora R. Reclassification of Shewanella putrefaciens Owen's genomic group II as Shewanella baltica sp. nov. International Journal of Systematic Bacteriology, 1998. N 48, P. 179-186.

2) Vogel B. F., Venkateswaran K., Satomi M., Gram L. Identification of Shewanella baltica as the Most Important H₂S-Producing Species during Iced Storage of Danish Marine Fish. Applied and Environmental Microbiology, 2005. Vol. 71, N 11, P. 6689-6697.