2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
Задание 4. PubMed - поисковая система БД Medline
В директории .../Pr4 создайте файл для протоколирования текущих результатов. Итоговые результаты нужно оформить на вашей html странице
Дан сайт посттрансляционной модификации гистона H4 (см. таблицу)
Задача: используя поисковую систему PubMed, описать, что известно о данной посттрансляционной модификации в клетках человека.
Ваша задача состоит в том, чтобы понять (или выдвинуть гипотезу), для чего осуществляется такая модификация, какими белками она осуществляется, какие белки осуществляют обратную модификацию у человека. На пути к цели могут быть трудности. Весьма возможно, что конкретный ответ на заданный вопрос еще не опубликован. Например, эффекты данной модификации исследованы на клетках дрожжей и мышей, а не человека. В таком случае, вы можете сформулировать гипотезу о том, что у человека данная модификация выполняет сходную функцию, но помните, что это гипотеза, а не ссылка на экспериментальный результат. Возможно (даже весьма вероятно), что литературные данные могут противоречить друг другу. Все это должно как-то влиять на вашу уверенность в достоверности и полноте полученных результатов.
1. Зарегистрируйтесь на сайте NCBI
Это необходимо, чтобы получить возможность формировать собственные коллекции публикаций.
На главной странице PubMed пройдите по ссылке Sign In
- Выберите ссылку Register
- Следуйте инструкциям
2. Составьте запросы и сохраните подходящие статьи в коллекции
Напишите запрос, используя искомые слова, операторы AND, OR; "*" допускается только в конце слова
. Ищите в нужных полях: [TI] - Title, [TIAB] - Title/Abstract и других (см. подсказки) - Используйте слова histone, название вашего сайта модификации, human, cell и др. Для составления запроса можно использовать форму Advanced search
- Сохраните
- запрос в том виде, как его поняла система Pubmed: см. Search details, See more и там - Translation;
- число найденных публикаций;
- число открытых публикаций (реально МГУ подписан и на ряд "не открытых");
- число найденных обзоров (Review).
- Повторяйте поиск, чтобы найти наиболее подходящие статьи. Полезные возможности:
- ограничить находки обзорами, щелкнув по ограничителю "Review"
- использовать открытые публикации, ограничитель "Free full texts"
- искать по ссылкам, которые приведены в тексте публикаций
- найдя подходящую статью, открыть её аннотации и далее пройти по ссылке "Related citation" - по мнению Pubmed, статьи на близкие темы.
- По мере поиска, отмечайте интересующие вас статьи и отправьте их (Send to) в коллекцию. Создайте коллекцию публикаций, адрес которой внесите в протокол.
3. Созданную коллекцию публикаций сделайте доступной для проверки
- Нажмите на ссылку Private и укажите для данной коллекции Public.
- Оставьте не менее трех и не более пяти публикаций, наиболее отвечающих заданной теме
4. Оформите результаты на html странице своего сайта
- Обязательная информация:
- Адрес вашей коллекции в Pubmed, открытый для проверки
- Описание двух публикаций на русском:
- Номер статьи в коллекции
- Описание: о чем говорится в статье, по вашему мнению (одна - две фразы)
- цитата(ы), на котрых основано ваше описание
- ссылка на pdf с полным текстом статьи (если доступен).
- Ваше заключение: что поняли про гистон H4
Как будет оцениваться
- Человеконечитаемые (мелкие, написанные цветом фона, недоступные по ссылкам и пр.) веб-страницы не проверяются.
- Обзоры без доступного полного текста не принимаются
- Каждая найденная статья (экспериментальная или обзор) с датой публикации 2006 года или более поздняя = +3 балла
- Статья 2000-2005 = + 2 балла
- Статья 1999 года или более ранняя = + 1балл
- Каждая статья с доступным полным текстом = +1 балл
- Бонус за детальность описания, адекватность восприятия и глубину проникновения в тему = от 0 до 5 баллов