Создание выборки белков с функциями, одинаковыми с TolB protein precursor E.coli


Задача - создать выборку белков, имеющих то же описание функций в базе данных Swiss-Prot,
что и белок TolB protein precursor E.coli.




Часть 1.
Краткое описание прототипа по данным банка аминокислотных
последовательностей Swiss-Prot, release: дата создания 1 февраля 1991,
дата последнего исправления аннотации 15 марта 2004






Часть 2.
Описание процедуры составления выборки


В качестве поисковой системы использовалась система SRS ( http://srs.ebi.ac.uk).


Поиск велся по следующим параметрам:

в поле DESCRIPTION вносился вариант названия белка:
tolB protein precursor ,
в поле SPECIES - названия организмов, среди которых ведется поиск:
Escherichia coli | Yersinia pestis | Pasteurella multocid .
Далее производился поиск среди других таксонов.

Поиск велся по банку данных UniProt, найденные записи просматривались в формате SwissProt.








Часть 3.
Описание выборки




Переход на главную страничку здесь.