На страницу седьмого семестра
Рассеяние на кристалле, разрешение гармоники, разрешение структуры, фазовая проблема.
Задание 1
Статья про структуру белка MAF_BACSU
Статья, ссылка на которую содержится в файле PDB - Functional implications from crystal structures of the conserved Bacillus subtilis protein Maf with and without dUTP.Задание 2
Информация о гомологах белка в PDB, собранная при помощи BLAST
Custom Report.xls
Задание 3
Краткое описание белка MAF_BACSU
a. Главный биологический результат статьи состоит вот в чем. Была получена структура белка MAf, из пространственных характеристик белка сделан вывод о том, что он может быть ДНК-связывающим. b. Разрешение структуры - 1.85 A. c. Фазовая проблема решена методом многоволнового аномального рассеяния. d. Количество измеренных структурных факторов - 40372. Процент имеющих силу сигнала более 3.0 - 100% (самое низкое значение фактора 10,82). e. R-фактор равен 0.195, R-free фактор равен 0.223. f. Источники: статья, PDB файл, EDS. g. Построено выравнивание полной последовательности белка (из Uniprot) и белка, представленного в PDB файле, с помощью JalView.
Верхние две последовательности загружены как fasta из pdb банка, третья - из uniprot, и две последнии загружены непосредственно из pdb файла, в них отсутствуют четыре С- концевые аминокислоты.