На странцу первого семестра
Исследование вторичной структуры белка MAF_Bacsu
Число бета-тяжей- 8
Число реверсивных поворотов- 13
Данный белок относится к типу альфа+бета
альфа-спираль 42-60 (номера а.о.)
антипараллельный бета-тяж 100-111 и 114-126 и примыкающие к нему.
параллельный бета-тяж 65-75,5-7,26-27
бета-поворот 139-142
Паттерн для водородных связей H (i,i+4) при i от 42 до 56
Н (i,i+3)при i=56
C-бета атомы расположены наружу от остова альфа -спирали.
а)Антипараллельная структура
Положение C-бета атомов относительно остова структуры, чередуется вверх-вниз (вправо -влево), причем это чередование синхронно для всех антипараллельных друг другу бета-тяжей структуры.
Паттерн для водородных связей H(i,i+2)для i=103,108,102,122,123. 2H(i,i+4*n-1),i от 101 до 111, n своё для каждого i соответственно от 1 до 6.
б)Параллельная структура
Структура слишком маленькая,чтобы говорить о паттерне для водородных связей в ней.
Положение атомов с-бета в параллельных тяжах аналогично таковому в антипараллельных.
Выбранный поворот-GLU139-THR140-LYS141-GLU142
Поворот скрепляют следующие водородные связи: LYS141:A.N-ILE138:A.O ,TYR137:A.O-GLU142:A.N, в меньшей степени: APSP145:A.N-GLU142:A.O, GLU13:A.N-TRP135:A.O