Примеры контактов между боковыми группами а.о. белка MAF_Bacsu

1. Пример гидрофобного взаимодействия
   
   Остаток лейцина представлен в шарнирной модели, контактирующие с ним фенилаланины представлены в проволочной модели, а их непосредственно контактирующие атомы в виде шариков среднего размера, все атомы раскрашены по химическим элементам.
2. Примеры водородных связей между боковыми группами
   • Донором и акцептором водорода являются атомы кислорода.
     
   • Донором и акцептором водорода являются атомы азота.
     
     Наименьшее расстояние между атомами азота(3.91), между которыми могла бы возникать водородная связь в моем белке превышает допустимое(3.5).Вероятно в нём нет водородных связей, образованных таким образом.(за счёт двух азотов)
3. Пример дисульфидного мостика
   • Дисульфидные мостики в инсулине
     
   • Дисульфидный мостик в моём белке
     
     В белке MAF_Bacsu 2 дисульфидных мостика.Это означает, что возможно он является секретируемым,т.е. выделяется клеткой во внешнюю среду. Объясняется это тем,что образование дисульфидного мостика связано с окислением цистеина, которому препятствует восстановительная среда внутри самой клетки.