Банк последовательностей белков UniProt

Белок 1LV7
Метка поля
Содержание
Код(ы) доступа ("Accession number")
 AC
P0AAI3; P28691; Q2M934
Идентификатор записи в БД
ID
FTSH_ECOLI
Название (краткое описание) белка
DE
белкок клеточного деления FTSH
Дата создания документа
DT
October 11, 2005
Дата последнего исправления аннотации
DT
December 16, 2008
Число публикаций, использованных при создании документа
RN
12
Журнал и год самой поздней публикации
RL
Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006)
Ключевые слова
KW
3D-structure; ATP-binding; Cell cycle; Cell division;  Cell inner membrane; Cell membrane; Complete proteome; Hydrolase;  Membrane; Metal-binding; Metalloprotease; Nucleotide-binding;  Protease; Transmembrane; Zinc.
Что содержит поле комментариев?
CC
Функции: Предположительно, похож на АТФ зависимую цинк пептидазу, связанная с разрушением цитоплазмотических белков с С-конца. Этот белок высвобождается с 11ого аминного неполярного хвоста с помощью механизма вовлекающего стабильную РНК

Кофактор: связывается с цинком через подгруппы

Местонахождение:клеточная внутренняя мембрана

В N-конце соответствует ААА АТФазному семейству

В С-конце соответствует пептидазе М41
Идентификаторы записей PDB
DR
 1LV7
 

1) Расположения белка 1LV7: внутриклеточная мембрана; мембранный белок

2) Воздействовать на область 5 – 24 (Transmembrane)
Метка поля
1LV7
YME1L1
Первый код доступа
AC
P0AAI3
Q96TA2
Идентификатор последовательности в БД
ID
FTSH_ECOLI
YMEL1_HUMAN
Название (краткое описание) белка
DE
белкок клеточного деления FTSH

АТФ-зависимая металлопротеаза YME1L1

АТФ-зависимая металлопротеаза FTSH1

 
Дата создания документа
DT
October 11, 2005
April 13, 2004
Дата последнего исправления аннотации
DT
December 16, 2008
April 13, 2004
Название организма
OS
Escherichia coli (strain K12)
Homo sapiens (Human)
Классификация организма (список таксонов)
OC
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
Enterobacteriaceae; Escherichia
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
Catarrhini; Hominidae; Homo
Длина последовательности
SQ
644
773
Молекулярная масса белка
SQ
70,708
86,455
Число публикаций, использованных при создании документа
RN
12
5
Журнал и год самой поздней публикации
RL
Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006)
Genome Res. 14:2121-2127(2004)
Описание вторичной структуры 
FT

Цепь одна

Аминокислот 644

13-альфа спиралей

8-бета тяжей

1 поворот

Активный сайт - 415

Металл-связывающий сайт-414, 418

Цепь одна

Аминокислот 773

Активный сайт - 600

Металл-связывающий сайт-599, 603

Нуклеотид-связывающая область 379 – 386
Ключевые слова
KW
3D-structure; ATP-binding; Cell cycle; Cell division;  Cell inner membrane; Cell membrane; Complete proteome; Hydrolase;  Membrane; Metal-binding; Metalloprotease; Nucleotide-binding;  Protease; Transmembrane; Zinc.
Alternative splicing; ATP-binding; Hydrolase; Metal-binding;
Metalloprotease; Mitochondrion; Nucleotide-binding; Protease; Zinc.
Темы, освещённые в комментариях
CC
Функции: Предположительно, похож на АТФ зависимую цинк пептидазу, связанная с разрушением цитоплазмотических белков с С-конца. Этот белок высвобождается с 11ого аминного неполярного хвоста с помощью механизма вовлекающего стабильную РНК

Кофактор: связывается с цинком через подгруппы

Местонахождение:клеточная внутренняя мембрана

N-конец соответствует ААА АТФазному семейству

С-конец соответствует пептидазе М41

Функция:Преполагаемая АТФ-зависимая протеаза, которая играет роль в митохондриальном белковом метаболизме.

Кофактор: связывается с цинком через подгруппы

Местонахождение:митохондрии

N-конец соответствует ААА АТФазному семейству

С-конец соответствует пептидазе М41
Особенности последовательности
FT
-
-
Идентификаторы записей PDB
DR
1LV7
YME1L1

 
 Запрос 
Число записей
в SwissProt
Число записей
в TrEMBL
Cell division
96
2,081
protease ftsH
88
728
EC=3.4.24
2,332
3,613
ftsH
96
2,081
Cell division protease ftsh
70
84


Белки, имеющие третичную структуру и похожие на мой белок: FTSH_HELPY и FTSH_AQUAE
 

© Замараев Алексей