α -спираль белка 1LV7

 

α-спираль 1lv7 (3,5 витка 327(Val)-338(Met) цепи A)

Водородные связи в α-спирали

(Синими участки отмечены атомы азота остовной цепи, красным - атомы кислорода остовной цепи,

пунктирными линиями - водородные связи между кислородами и азотами остовной цепи.)

 

Атомы азота и кислорода в остовной цепи α-спирали, пунктиром обозначены водоодные связи

 

 

 

Водородные связи в α-спирали (327-338:A)
Атом Аминокислота Номер Цепь   Атом Аминокислота Номер Цепь
O
ARG
328
A
-
N
GLN
332
A
O
GLU
329
A
-
N
ILE
333
A
O
VAL
327
A
-
N
GLU
331
A
O
ARG
330
A
-
N
LEU
334
A
O
GLU
331
A
-
N
LYS
335
A
O
ILE
333
A
-
N
HIS
337
A
O
GLN
332
A
-
N
VAL
336
A
O
LEU
334
A
-
N
MET
338
A

 

С помощью рисунка можно сформулировать правило образования водородных связей в альфа-спирали белка.

В типе водородная связь образуется между карбонильным остовным кислородом a-го остатка и амидным остовным азотом (a+4)-го остатка.

 

 

© Замараев Алексей