step i1-i2 i1-j2 j1-i2 j1-j2 sum 1 CG/CG 0.76( 0.01) 0.00( 0.00) 3.20( 0.72) 0.46( 0.00) 4.42( 0.73) 2 GG/UC 2.38( 0.91) 0.00( 0.00) 0.08( 0.00) 0.33( 0.00) 2.79( 0.91) 3 GA/UU 3.72( 2.19) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 2.58( 0.89) 6.30( 3.08) 4 AU/AU 4.79( 3.43) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 3.04( 1.74) 7.83( 5.18) 5 UU/AA 0.79( 0.01) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 3.15( 2.66) 3.93( 2.66) 6 Uc/GA 0.82( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 3.37( 1.85) 4.20( 1.85) 7 cU/AG 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.43( 0.00) 3.87( 2.83) 4.30( 2.83) 8 UG/CA 0.17( 0.00) 0.00( 0.00) 2.60( 1.28) 0.13( 0.00) 2.90( 1.28) 9 GU/AC 6.87( 3.89) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 3.54( 1.98) 10.41( 5.87) 10 UG/CA 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 4.46( 2.20) 0.00( 0.00) 4.46( 2.20) 11 Gu/aC 8.81( 4.20) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 4.17( 0.85) 12.98( 5.05) 12 uP/Ga 5.72( 1.89) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 8.48( 3.73) 14.20( 5.62) 13 PA/cG 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 14 AP/Ac 4.50( 1.95) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 6.77( 3.74) 11.27( 5.69) 15 Pc/GA 1.75( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 5.14( 3.31) 6.88( 3.31) 16 cU/AG 0.07( 0.00) 0.00( 0.00) 0.71( 0.00) 0.72( 0.72) 1.49( 0.72) 17 UG/CA 0.07( 0.00) 0.00( 0.00) 3.07( 1.75) 0.04( 0.00) 3.18( 1.75) 18 GG/CC 2.97( 1.47) 0.00( 0.00) 0.36( 0.00) 0.20( 0.00) 3.53( 1.47) 19 GA/gC 3.66( 1.01) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 5.48( 2.64) 9.14( 3.65) 20 Ag/Cg 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.35( 0.00) 1.83( 0.78) 2.18( 0.78) 21 gC/GC 3.38( 0.62) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 7.14( 3.85) 10.52( 4.46) 22 CU/AG 1.05( 0.02) 0.00( 0.00) 0.03( 0.00) 2.47( 2.16) 3.55( 2.18) 23 UC/GA 1.26( 0.30) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 1.00( 0.06) 2.26( 0.36) 24 CA/UG 0.00( 0.00) 1.98( 0.00) 2.24( 0.18) 0.00( 0.00) 4.22( 0.18) 25 AG/CU 2.43( 0.70) 0.00( 0.00) 0.16( 0.00) 0.00( 0.00) 2.58( 0.70) 26 GG/CC 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 27 Gg/UC 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 28 gA/UU 3.62( 2.17) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.25( 0.00) 3.87( 2.17) 29 AA/UU 2.74( 2.59) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.26( 0.00) 3.00( 2.59)