Банк UniProt



Главная

Назад

Данные белка pstS из файла P0AG82.txt
  Метка поля Содержание
Код(ы) доступа ("Accession number") AC P0AG82; P06128; P76744; Q2M846;
Идентификатор записи в БД ID PSTS_ECOLI
Название (краткое описание) белка DE Phosphate-binding protein pstS(PBP)
Дата создания документа DT 01-01-1988
Дата последнего исправления аннотации DT 16-12-2008
Число публикаций, использованных при создании документа RN 9
Журнал и год самой поздней публикации RL Molecular Systems Biology, 2006
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome; Direct protein sequencing; Periplasm; Phosphate transport; Signal; Stress response; Transport.
Что содержит поле комментариев? CC Функция: часть ABC транспортного комплекса pstSABC, учавствующего в импорте фосфата

Субъединица: комплекс состоит из 2 АТФ-связывающих белков (pstB), 2 трансмембранных
белков (pstC и pstA) и белка, связывающего растворенные вещества (pstS) (Возможно)

Внутриклеточное положение: периплазма

Индукция: путем ограничения фосфата. Регулируется положительно phoB, регулируется отрицательно phoR

Сходство с другими белками: принадлежит семейству белков pstS

Идентификаторы записей PDB DR 1A40; 1A54; 1A55; 1IXG; 1IXH; 1IXI; 1OIB; 1PBP; 1QUI; 1QUJ; 1QUK; 1QUL; 2ABH;


Опиcание функции и состава комплекса, в который входит данный белок, и локализация белка в клетке E.coli.

Белок pstS входит в состав транспортного комплекса pstSACB, учавствующего в импорте фосфата. Комплекс состоит из двух АТФ-связывающих белков (pstB),
двух трансмембранных белков (pstC и pstA) и белка, связывающего растворенные вещества (pstS). В клетке E.coli белок локализован в периплазме клетки.

Положение сигнального пептида в последовательности и роль этого пептида.

Сигнальный пептид в данной последовательности начинается с первой аминокислоты и заканчивается двадцать пятой (1-25). Роль этого пептида заключается
в направлении пост-трансляционного транспорта белка в соответствующую органеллу.

Поиск на сайте UniProt записей, описывающих белки примерно с тем же описанием, что и белок pstS

Запрос Число записей в SwissProt Число записей в TrEMBL
Phosphate-binding protein pstS 37 291
PBP 462 14,301
"Phosphate-binding protein pstS" 36 99


Сравнение с другим белком
  Метка поля Белок Psts_E.coli Белок Psts_XYLFA
Код(ы) доступа ("Accession number") AC P0AG82 Q9PBK3
Идентификатор записи в БД ID PSTS_ECOLI PSTS_XYLFA
Название (краткое описание) белка DE Phosphate-binding protein pstS(PBP) Phosphate-binding protein pstS(PBP)
Дата создания документа DT 01-01-1988 23-01-2002
Дата последнего исправления аннотации DT 16-12-2008 25-11-2008
Название организма OS Escherichia coli (strain K12) Xylella fastidiosa
Классификация организма (список таксонов) OC

Царство Бактерии(Bacteria);

Тип Протеобактерии(Proteobacteria);

Класс Гамма-протеобактерии(Gammaproteobacteria);

Порядок Энтеробактерии(Enterobacteriales);

Семейство Энтеробактерии(Enterobacteriaceae);

Род Escherichia;

Вид Escherichia Coli(кишечная палочка)

Царство Бактерии(Bacteria);

Тип Протеобактерии(Proteobacteria);

Класс Гамма-протеобактерии(Gammaproteobacteria);

Порядок Ксантомонады(Xanthomonadales);

Семейство Ксантомонады(Xanthomonadaceae);

Род Ксилелла(Xylella);

Вид Xylella fastidiosa

Длина последовательности SQ 346 364
Молекулярная масса SQ 37024 дальтон(а.е.м.) 38737 дальтон(а.е.м.)
Число публикаций, использованных при создании документа RN 9 1
Журнал и год самой поздней публикации RL Molecular Systems Biology, 2006 Nature, 2000
Описание вторичной структуры FT Вторичная структура белка представлена бета-тяжами(9), альфа-спиралями(13) и поворотами(3) данных о вторичной структуре нет
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome; Direct protein sequencing; Periplasm; Phosphate transport; Signal; Stress response; Transport Complete proteome; Periplasm; Phosphate transport; Signal; Transport
Темы, освещённые в комментариях CC

Функция

Субъединица

Внутриклеточное положение

Индукция

Сходство с другими белками

Функция

Субъединица

Внутриклеточное положение

Сходство с другими белками
Особенности последовательности FT в последовательности есть сигнальный пептид (1-25 ак) в последовательности есть сигнальный пептид (1-18 ак)
Идентификаторы записей PDB DR 1A40; 1A54; 1A55; 1IXG; 1IXH; 1IXI; 1OIB; 1PBP; 1QUI; 1QUJ; 1QUK; 1QUL; 2ABH; нет

Очевидно, что белок PSTS_XYLFA еще недостаточно изучен. Я могу предположить, что его изучение связано с поиском лечения
болезни Пирса винограда, вызываемой бактерией Xylella fastidiosa и которая приносит большой урон сельскому хозяйству.
Все, что изучено в этом белке есть в моем. Наверное, самое интересное в сравнении этих белков - это наличие общей интересной
особенности - сигнального пептида.

Дополнительное задание

Следуя примеру, описанному в ролике-демонстрации, выполнила поиск белков с третичной структурой среди белков, похожих на PSTS_E.COLI.

Результаты показали, что третичной структурой обладает лишь PSTS_E.COLI.

Краткую информацию о белке можно прочитать в файле PstS_Ecoli














© Ксения Лежнина 2008