Эволюционная модель
Исходная последоваельность гена MetJ была мутирована при помощи програмы msbar пакета EMBOSS. Ниже приведено дерево в соответствии с которым мутировалась последовательность нуклеотидов. Для ускорения работы был использован скрипт, приведённый ниже.
Дерево:
Скрипт:
msbar MetJ Ae -point 4 -count 318 -auto msbar MetJ 1e -point 4 -count 95 -auto msbar 1e Be -point 4 -count 223 -auto msbar 1e 2e -point 4 -count 64 -auto msbar 2e 3e -point 4 -count 32 -auto msbar 3e Ce -point 4 -count 159 -auto msbar 3e De -point 4 -count 159 -auto msbar 2e 4e -point 4 -count 64 -auto msbar 4e Ee -point 4 -count 127 -auto msbar 4e Fe -point 4 -count 127 -auto
Анализ модели
Определение эволюционного расстояния между нуклеотидными последовательностями