Метка поля | Содержание | |
Код(ы) доступа ("Accession number") | AC | P29208; P76476; P76931; |
Идентификатор записи в БД | ID | MENC_ECOLI Reviewed; 320 AA. |
Название (краткое описание) белка | DE | Полное: o-succinylbenzoate synthase; сокращённое: OSB synthase или OSBS;
EC=4.2.1.113; полное химическое название: 4-(2'-carboxyphenyl)-4-oxybutyric acid synthase или o-succinylbenzoic acid synthase; |
Дата создания документа | DT | 01-DEC-1992 |
Дата последнего исправления аннотации | DT | 20-JAN-2009 |
Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 6 |
Журнал и год самой поздней публикации | RL | Biochemistry 39:10662-10676(2000). |
Ключевые слова | KW | 3D-structure; Complete proteome; Lyase; Magnesium; Menaquinone biosynthesis; Metal-binding. |
Что содержит поле комментариев? | CC | Функция: преобразование SHCHC () в OSB ().
Каталитическая активность: (1R,6R)-6-hydroxy-2-succinylcyclohexa-2,4- diene-1-carboxylate = 2-succinylbenzoate + H(2)O. Кофактор: магний. Путь: биосинтетический кофактор; биосинтез менакинона; менокинон из chorismate: шаг 4/8. Сходство: принадлежит к mandelate racemase/muconate lactonizing семейству ферментов. 1 подсемейство типа MenC. ОХРАНЯЕТСЯ авторским правом Консорциума UniProt, смотри http://www.uniprot.org/terms Распространяется под Творческой Общей Лицензией Attribution-NoDerivs |
Идентификаторы записей PDB | DR | 1FHU, 1FHV, 1R6W, 2OFJ |
Запрос | Число записей в SwissProt |
Число записей в TrEMBL |
"4-(2'-carboxyphenyl)-4-oxybutyric acid synthase" | 44 | 4 |
EC=4.2.1.113 | 44 | 0 |
OSB | 112 | 92 |
o succinylbenzoate synthase | 44 | 96 |
Метка поля | Белок 1 | Белок 2 | |
Первый код доступа | AC | P29208 | P58485; |
Идентификатор последовательности в БД | ID | MENC_ECOLI Reviewed; 320 AA. | MENC_SALTI Reviewed; 320 AA. |
Название (краткое описание) белка | DE | RecName: Full=o-succinylbenzoate synthase;
Short=OSB synthase; Short=OSBS; EC=4.2.1.113; AltName: Full=4-(2'-carboxyphenyl)-4-oxybutyric acid synthase; AltName: Full=o-succinylbenzoic acid synthase; |
RecName: Full=o-succinylbenzoate synthase;
Short=OSB synthase; Short=OSBS; EC=4.2.1.113; AltName: Full=4-(2'-carboxyphenyl)-4-oxybutyric acid synthase; AltName: Full=o-succinylbenzoic acid synthase; |
Дата создания документа | DT | 01-DEC-1992 | 19-DEC-2001 |
Дата последнего исправления аннотации | DT | 20-JAN-2009 | 20-JAN-2009 |
Название организма | OS | Escherichia coli (strain K12) | Salmonella typhi |
Классификация организма (список таксонов) | OC | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
Enterobacteriaceae; Escherichia. |
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
Enterobacteriaceae; Salmonella. |
Длина последовательности | ID,SQ | 320 AA | 320 AA. |
Молекулярная масса белка | SQ | 35477 MW | 35359 MW |
Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 6 | 2 |
Журнал и год самой поздней публикации | RL | Biochemistry 39:10662-10676(2000). | J. Bacteriol. 185:2330-2337(2003). |
Описание вторичной структуры
Вообще-то, как такового этого писания нет - но видна информация, что белки одноцепочечные, и ещё кое-что) |
FT | CHAIN 1 320 o-succinylbenzoate synthase.
/FTId=PRO_0000171270. ACT_SITE 133 133 Proton donor. ACT_SITE 235 235 Proton acceptor. METAL 161 161 Magnesium. METAL 190 190 Magnesium. METAL 213 213 Magnesium. CONFLICT 176 177 Missing (in Ref. 1; AAA71917). |
CHAIN 1 320 o-succinylbenzoate synthase.
/FTId=PRO_0000171274. ACT_SITE 133 133 Proton donor (By similarity). ACT_SITE 235 235 Proton acceptor (By similarity). METAL 161 161 Magnesium (By similarity). METAL 190 190 Magnesium (By similarity). METAL 213 213 Magnesium (By similarity). |
Ключевые слова | KW | 3D-structure; Complete proteome; Lyase; Magnesium;
Menaquinone biosynthesis; Metal-binding. |
Complete proteome; Lyase; Magnesium; Menaquinone biosynthesis;
Metal-binding. |
Темы, освещённые в комментариях
Пускай слева будет по-русски, а справа- по-английски- всё равно одно и тоже) |
CC | Функция: преобразование SHCHC () в OSB ().
Каталитическая активность: (1R,6R)-6-hydroxy-2-succinylcyclohexa-2,4- diene-1-carboxylate = 2-succinylbenzoate + H(2)O. Кофактор: магний. Путь: биосинтетический кофактор; биосинтез менакинона; менокинон из chorismate: шаг 4/8. Сходство: принадлежит к mandelate racemase/muconate lactonizing семейству ферментов. 1 подсемейство типа MenC. ОХРАНЯЕТСЯ авторским правом Консорциума UniProt, смотри http://www.uniprot.org/terms Распространяется под Творческой Общей Лицензией Attribution-NoDerivs |
FUNCTION: Converts SHCHC to OSB (By similarity).
CATALYTIC ACTIVITY: (1R,6R)-6-hydroxy-2-succinylcyclohexa-2,4- diene-1-carboxylate = 2-succinylbenzoate + H(2)O. COFACTOR: Magnesium (By similarity). PATHWAY: Cofactor biosynthesis; menaquinone biosynthesis; menaquinone from chorismate: step 4/8. SIMILARITY: Belongs to the mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family. MenC type 1 subfamily. Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License |
Особенности последовательности | FT | Цепь - одна, 320 аминокислот; о-сукцинилбензоат синтаза. Активная область - 133-й остаток: донор протонов; акт. область - 235-й участок: акцептор протонов; к остаткам под номерами 161, 190, 213 присоединён металл-лиганд - Mg. В районе 176-177 аминокислот - противоречие: отсутствие...(in Ref. 1; AAA71917) далее - повороты, связки, спирали... |
Цепь - одна, 320 аминокислот; о-сукцинилбензоат синтаза. Активная область - 133-й остаток: донор протонов; акт. область - 235-й участок: акцептор протонов; к остаткам под номерами 161, 190, 213 присоединён металл-лиганд - Mg. |
Идентификаторы записей PDB | DR | 1FHU, 1FHV, 1R6W, 2OFJ | 1FHU |
Таким образом, сходство налицо.) Однако несколько меньшее количество данных, статей и пр. в правой колонке, нежели в левой,
может свидетельствовать о меньшей изученности MENC_SALTI у Salmonella typhi, по сравнению с MENC_ECOLI.
К блоку
Ко 2му семестру
На главную