| Характеристика паттерна |
Паттерн |
В скольких последовательностях банка Swiss-Prot
найден мотив, удовлетворяющий паттерну? |
Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
| Фрагмент последовательности |
Y-P-Y-Q-L-S-S-E-E-V-V-E-E-M-M-S-H |
В одной |
Нет, только одна - YODA_ECOLI |
| Сильный |
Y-P-[SYD]-[KQN]-[ML]-[DS]-[GS]-[HEQ]-[DE]-[IV]-[AV]-[HEQ]-E-M-[ML]-[SA]-H |
С помощью данного паттерна было найдено 4 последовательности. |
Все три последовательности из моего выравнивания были найдены. |
| Слабый |
P-X(2)-{YWRK}-[DS]-[GS]-X-[DE]-[IV]-[AV]-X-E-M-[ML] |
Было найдено 4 последовательности |
Все три последовательности из моего выравнивания были найдены. |
| Идентификатор документа PROSITE (AC) |
Название мотива |
Краткое описание мотива |
Тип подписи (паттерн, профиль) |
Паттерн (регулярное выражение) |
Специфична ли подпись? |
Сколько мотивов нашлось в белке? |
| PS00006 |
CK2_PHOSPHO_SITE |
Казеинкиназа II фосфорилирующий сайт |
паттерн |
[ST] - x(2) - [DE] |
неспецифична |
6 |
| PS00001 |
ASN_GLYCOSYLATION |
сайт N-гликолизирования |
паттерн |
N - {P} - [ST] - {P} |
неспецифична |
3 |
| PS00008 |
MYRISTYL |
N-мирилизирующий сайт |
паттерн |
G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} |
неспецифична |
2 |
| PS00005 |
PKC_PHOSPHO_SITE |
Протеинкиназа С фосфорилирующий сайт |
паттерн |
[ST] - x - [RK] |
неспецифична |
4 |
| PS00007 |
TYR_PHOSPHO_SITE |
Тирозинкиназа фосфорилирующий сайт |
паттерн |
[RK] - x(2) - [DE] - x(3) - Y or [RK] - x(3) - [DE] - x(2) - Y |
неспецифична |
1 |
| PS00009 |
AMIDATION |
Сайт амидирования |
паттерн |
x - G - [RK] - [RK] |
неспецифична |
1 |
| PS00004 |
CAMP_PHOSPHO_SITE |
cAMP- и cGMPзащитный протеинкиназа фосфорилирующий сайт |
паттерн |
[RK](2) - x - [ST] |
неспецифична |
1 |
