|
В рамках работы была выполнена следующая команда для записи D89965
>getorf -table 11 -find 1 -minsize 30
В выводе программы оказались интересными следующие рамки
|
рамка соответствующая приведённой в записи CDS
|
>D89965_5 [19 - 432] Rattus norvegicus mRNA for RSS, complete cds
MVFWLHHVTVTGDDKRCSFIRDCQQCFKFAQHAIGTPVFCQLNGGFDQMALMHFQFTFKQ
FEQRKSIRSTARKARDDFVVVQTADLFHVAFHYGIAQRGLTITSDDHMAVTAYAYYSCHE
LTPWLRIQSTNPVQKYGA
| |
рамка соответствующая записи Swiss-Prot, на которую ссылается данная запись EMBL
|
>D89965_13 [375 - 1] (REVERSE SENSE) Rattus norvegicus mRNA for RSS, complete cds
MTTIVSVRRNGHVVIAGDGQATLGNTVMKGNVKKVRRLYNDKVIAGFAGGTADAFTLFEL
FERKLEMHQGHLVKAAVELAKDWRTDRMLRKLEALLAVADETASLIITGNGDVVQPENDL
IAIGS
|
Таким образом, по-видимому, произошла ошибка при выборе открытой рамки считывания у авторов записи
|
На главную
Второй семестр
|